Mystérieusement détruit par son propre missile, un sous-marin russe aurait été contrôlé, à distance, par une intelligence artificielle nommée «l'Entité». Ethan Hunt et son équipe sont décidés à éradiquer cette nouvelle menace avant qu'elle tombe dans de mauvaises mains et menace l'humanité. Traqué par le monde entier, Hunt va se rendre à Abu Dhabi, Venise, Rome et dans les Alpes autrichiennes pour échapper à cette Entité qui connaît tout de lui et qui s'est alliée à ses ennemis.