Des équipes SG 11 sont envoyées sur le site alpha pour tenter d'évacuer les blessés. Mais la porte est couchée...Les soldats d'Anubis ont fait déjà beaucoup de dégâts. Seule solution pour détruire les vaisseaux Goaold, envoyer une sonde équipée de missiles. Le Pentagone décide à ce moment de mener une enquête car il y aurait eu des fuites d'informations au sein des membres de l'équipage. Pendant ce temps, le major Samantha Carter parvient à s'échapper avec le prototype de la seule arme capable de tuer les soldats d'Anubis avant leur arrivée...